线粒体内的DNA(称为mtDNA)与细胞核内的DNA不同，mtDNA所有的DNA都来自于我们的母亲。换句话说，与细胞核内的DNA不同，它不是我们父母的DNA的混合物，每个人的mtDNA几乎与他/她母亲的mtDNA完全相同。一般常用于母系遗传之间的DNA鉴定，例如外婆与外孙女之间的DNA鉴定。